《九门》是《老九门》的续作，两者都属于是《盗墓笔记》的前传，讲述的是吴邪祖父吴老狗一辈的故事。
在民国时期，老长沙有着九个大家族，被称为老九门，也称九门提督。这九家都是以倒斗发家，白话来说就是九个以盗墓发家的家族，九家以长沙布防官张大佛爷张启山为首，其余八家当家人有土匪，有杀手，有做生意的，彼此间虽然有利益摩擦，但也算是一个整体。
到剧版之中，自然是将老九门美化了。实际上，老九门就是地头蛇，而且他们做的是倒斗买卖，又是垄断一城的古董营生，每个人手头最少也是背着几条人命。
再是情节的话，《九门》分为了两部分，第一大部分就是下隔世楼寻找消失的401部队，还有一小部分是清剿九门。
首先，就是张启山手下的401部队消失，张启山、吴老狗、霍仙姑等人下隔世楼进行寻找。
隔世楼是长沙地下的一座建筑，是东汉方士阴长生的修炼道场。阴长生有一个痴迷法术邪道、长生秘法的徒弟，被驱逐后霸占道场篡改阵法扩建地宫，自立为隔世老祖。自此，阴长生的道场成为了隔世楼，进入后会陷入轮回幻境，无限循环。
张启山等人进入隔世楼后，经历了一系列神秘的事情。就比如张启山等人追寻401时，永远离他们有着800米；还有楼中一系列的怪物，诡异莫测，犹如真的有法术一样。
要是看过《老九门》或者笔记系列作品，就能知道这种法术、神怪之类的东西绝对不可能是真的。在这里之时，相信有着很大一部分人已经猜测出是幻觉了，必然与陨铜有关。
在盗墓笔记、老九门系列中，极其神秘的一样东西就是陨铜。陨铜是天外坠落的陨石，里面含有特殊放射性元素，其中有着一种作用就是致幻作用。这种东西在三叔笔下的各个系列中都有出现，剧版《老九门》中也是有陨铜，《九门》作为三叔监制的作品自然不会少了陨铜。
事实上，一切揭开的时候发现确实与陨铜有关。阴长生以陨铜炼制过一种特殊的丹药，名为致怪丹，药性无比强烈，大多数生灵服下后会死亡，但也有部分生灵服下后异化成怪物，拥有一些匪夷所思的能力。
按照五行划分，服下致怪丹的生灵会成为六种怪物。第一是金行的穿山甲，服用致怪丹会异化成彭蹻，它们异化的鳞片能让人情迷意乱；第二是木行的螳螂，服丹会异化成彭踞，分泌物能让人极度亢奋，看到的东西扭曲炫目；第三是水行的猪肉绦虫，服丹后异化成彭踬，能催生一种特殊的饥饿素，能让人产生无尽饥饿；第四是火行的野蛇，服丹后化身大蛇，分泌特殊的致幻素，吸入后会进入真假难辨的幻境；最后是特殊的土行，男人服丹后会变成多手怪，彻底异化后就是窄娘娘，而女人服丹则是会变成长发女。
还有一种特殊植物换尸草，是被致怪丹异化的牵牛花。虽然换尸草的外形与牵牛花一样，但有着一种特殊的毒性，能延缓新陈代谢的作用，使得人体的老废表皮难以脱落、堆积在一起，看上去苍老衰败，但却不会真正死亡。
这些生物都有奇特的能力，却又相互制衡。窄娘娘身上脱落的皮屑名为星月砂，能让人产生幻觉，导致记忆丢失，但燃烧祝融丝可以解星月砂之毒；换尸草之毒则由可以用星月砂来解。
在民国时期，日軍的鸠山美志发现了隔世楼的秘密。鸠山美志想要制造怪物和利用星月砂制造幻境，策划更大阴谋，才引诱张启山等人进入了隔世楼。
张启山等人进入隔世楼后，就中了星月砂之毒。实际上，张启山等人下过无数次隔世楼，每一次都寻找到了401部队，但因为难以将他们带出隔世楼，外出召集人手时却因为星月砂之毒忘记了已经下来过。因此，张启山等人一遍遍的下隔世楼寻找401部队。
由于隔世楼各处的星月砂浓度不一样，张启山等人每次下来保留的记忆也不一样。在这样的情况下，大脑就根据自己的逻辑将混乱的记忆片段重新按顺序罗列成了一段完整的记忆。这就有了张启山等人离401永远是800米的场景，实际上是无数次的记忆。
这场星月砂之毒的幻境阴谋自然也是被揭开了，张启山终结鸠山美志，带回401，隔世楼的故事结束。
在出隔世楼后，又是老九门面临被清剿的状况。老九门是地方帮会，势力庞大，路已经走断了，而且没有所谓的“杀六保三”，只会是“杀八保一”。这其中唯一能保下的就是九门之首的张大佛爷张启山，但他做不出这个决定。
这样的情况下，张启山、吴老狗一起布了一个局，还是使用星月砂。在回到长沙时，张启山已经让人将星月砂撒遍了长沙城，篡改了负责清剿九门的罗昂的记忆。最终，老九门的当家人除却解九是否真死不好说，其余八家都是得以幸存，但老九门已经转入暗面，各自都散了。
由于九门是笔记的前传，吴老狗、霍仙姑、陈皮阿四等人肯定是不会死了，结局必然是会圆一下的。要是细究的话，《九门》也是有着很多漏洞的，就说最后的星月砂救九门，隔世楼都毁了，撒遍长沙城篡改所有人记忆需要多少星月砂，星月砂的效力是多久......
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